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Accueil du site > Thèmes de recherche > Etudes structurales et fonctionnelles de nouvelles cibles thérapeutiques par RMN > Etudes structurales des protéines du complexe terminase du cytomégalovirus humain

Etudes structurales des protéines du complexe terminase du cytomégalovirus humain

Les protéines du complexe terminase du CMV humain, pUL56 et pUL89, sont essentielles pour le clivage de l’ADN viral et son empaquetage dans les virions nouvellement formés. L’étude de l’interaction entre ces deux protéines a permis d’identifier la région de pUL89 responsable de leur interaction et l’utilisation des outils bioinformatiques a permis la reconstruction de modèles théoriques des domaines spécifiques importants de ces protéines. Ainsi, nous avons proposé un modèle pour la dimérisation de la protéine pUL56, la structure des domaines hélicase et endonucléase de pUL89 et son domaine d’interaction avec pUL56. Le domaine de pUL56 impliqué dans l’interaction avec pUL89 a été précisément identifié. Le domaine hélicase de pUL89 a été déterminé par homologie avec la structure de gp17 (PDB 2o0J) du bactériophage T4 utilisant le programme PHYRE. L’ATP a été ancré dans le site actif du domaine hélicase de pUL89. Le modèle obtenu après minimisation est représenté en surface colorée en fonction de la répartition de charge. La queue polyphosphate est insérée dans une poche positivement chargée et stabilisée par la présence de l’ion Mg2+ (sphère magenta) et de deux molécules d’eau. Le nucléotide est contenu dans une poche apolaire.

Collaborations : S Alain, Limoges French National Cytomegalovirus Reference Center

Publications :
- Couvreux A, Hantz S, Marquant R, Champier G, Alain S, Morellet N, Bouaziz S (2010) Insight into the structure of the pUL89 C-terminal domain of the human cytomegalovirus terminase complex. Proteins 78 : 1520-30.
- Hantz S, Couvreux A, Champier G, Trapes L, Cotin S, Denis F, Bouaziz S, Alain S (2009) Conserved domains and structure prediction of human cytomegalovirus UL27 protein. Antiviral therapy 14 : 663-72.
- Champier G, Couvreux A, Hantz S, Rametti A, Mazeron MC, Bouaziz S, Denis F, Alain S (2008) Putative functional domains of human cytomegalovirus pUL56 involved in dimerization and benzimidazole D-ribonucleoside activity. Antiviral therapy 13 : 643-54.
- Champier G, Hantz S, Couvreux A, Stuppfler S, Mazeron MC, Bouaziz S, Denis F, Alain S (2007) New functional domains of human cytomegalovirus pUL89 predicted by sequence analysis and three-dimensional modelling of the catalytic site DEXDc. Antiviral therapy 12 : 217-32.