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Nom : Elisa Frezza

Maître de conférences Paris Descartes

Tel : 01-53-73-98-36

Courriel : Elisa Frezza

- Recherche

Mes activités de recherche portent sur les études théoriques et computationnelles de problèmes d’intérêt pour une large communauté, de la science des matériaux à la biologie. Ma recherche est donc interdisciplinaire, à l’interface entre physique, chimie, biologie et informatique et sur plusieurs échelles (de l’échelle moléculaire jusqu’à l’échelle méso et macro). Selon le problème et l’échelle de l’étude, je développe et/ou utilise différents modèles théoriques et méthodes computationnelles. Mes axes principales de recherche sont :

  • la modélisation des protéines et acides nucléiques et leurs interactions ;
  • le développement de modèles gros-grain ;
  • l’exploitation de l’analyse des modes normaux en coordonnées internes pour étudier des grands changements conformationnels dans les macromolécules ;
  • la modélisation de la propagation de la chiralité dans des systèmes auto-assemblants

- Collaborations :

- Enseignement

Biophysique et modélisation moleculaire pour les sciences pharmaceutiques

- Publications

  1. E. Frezza, J. Martin, R. Lavery « A molecular dynamics study of adenylyl cyclase : The impact of ATP and G-protein binding » Plos One, 2018, 13 (4), e0196207, DOI :10.1371/journal.pone.0196207
  2. G. Cinacchi, A. Ferrarini, E. Frezza, A. Giacometti, H.B. Kolli « Theory and simulation studies of self-assembly of helical particles » in Self-Assembling Systems : Theory and Simulation, Ed. Li-Tang Yan, John Wiley & Sons, 2017
  3. C. De Michele, G. Zanchetta, T. Bellini, E. Frezza, A. Ferrarini « Hierarchical propagation of chirality through reversible polymerization : the cholesteric phase of DNA oligomers » ACS Macro Letters 5 (2), 2016, 208-212, DOI :10.1021/acsmacrolett.5b00579
  4. F. Biscaglia, E. Frezza, E. Zurlo, M. Gobbo « Linker dependent chirality of solvent induced self-assembled structures of porphyrin-α-helical peptide conjugates » Org. Biomol. Chem., 2016, 14, 9568–9577, DOI : 10.1039/C6OB01633B
  5. P. De Gregorio, E. Frezza, C. Greco, A. « Ferrarini Density Functional Theory of nematic elasticity : softening from polar order » Soft Matter 2016, 12, 5188, DOI : http://dx.doi.org/10.1039/C6SM00624H
  6. E. Frezza, R. Lavery « Internal Normal Mode Analysis (iNMA) applied to protein conformational flexibility » J. Chem. Theory Comput. 2015, 11, 5503-5512, DOI : 10.1021/acs.jctc.5b00724
  7. H.B. Kolli, E. Frezza, G. Cinacchi, A. Ferrarini, A. Giacometti, T.S. Hudson C. De Michele, F. Sciortino « Self-assembly of hard helices : a rich and unconventional polymorphism » Soft Matter 2014, 10 (41), 8171-8187 DOI : 10.1039/C4SM01305K
  8. E. Frezza, A. Ferrarini, H.B. Kolli, A. Giacometti, G. Cinacchi « Left or right cholesterics ? A matter of helix handedness and curliness » Phys.Chem.Chem.Phys. 2014, 16, 16225-16232, DOI : 10.1039/C4CP01816H
  9. C. Greco, E. Frezza, A. Marini, A. Ferrarini, « From the Molecular Structure to Spectroscopic and Material Properties : Computational Investigation of a Bent‐Core Nematic Liquid Crystal » Chem.Phys.Chem. 2014, 15, 1336 – 1344, DOI : 10.1002/cphc.201301030
  10. E. Frezza, A. Ferrarini, H.B. Kolli, A. Giacometti, G. Cinacchi « Communication : From rods to helices : Evidence of a screw-like nematic phase » J. Chem. Phys. 2014, 140, 081101 DOI : 10.1063/1.4866808
  11. M. Ilk Capar, A. Nar, A. Ferrarini, E. Frezza, C. Greco, A.V. Zakharov, A.A. Vakulenko « Molecular structure and elastic properties of thermotropic liquid crystals : Integrated molecular dynamics—Statistical mechanical theory vs molecular field approach » J. Chem. Phys. 2013, 138, 114902, DOI : http:10.1063/1.4794920
  12. E. Frezza, A. Ferrarini, H.B. Kolli, A. Giacometti, G. Cinacchi « The isotropic-to-nematic phase transition in hard helices : theory and simulation » J. Chem. Phys. 2013, 138, 164906, DOI : http://dx.doi.org/10.1063/1.4802005
  13. E. Frezza, S. Pieraccini, S. Mazzini, A. Ferrarini, G.P. Spada « The interplay of configuration and conformation in helical perylenequinones : Insights from chirality induction in liquid crystals and calculations » Beilstein J Org Chem. 2012, 8, 155–163. DOI : 10.3762/bjoc.8.16
  14. E. Frezza, F. Tombolato, A. Ferrarini « Right-and left-handed liquid crystal assemblies of oligonucleotides : phase chirality as a reporter of a change in non-chiral interactions ? » Soft Matter, 2011, 7, 9291-9296, DOI : 10.1039/C1SM05472D
  15. M. Cestari, E. Frezza, A. Ferrarini, G.R. Luckhurst « Crucial role of molecular curvature for the bend elastic and flexoelectric properties of liquid crystals : mesogenic dimers as a case study » J. Mater. Chem., 2011, 21, 12303-12308, DOI : 10.1039/C1JM12233A